軟骨發育有藥物治療和手術治療兩種方式。
藥物治療：軟骨發育不全目前沒有特效藥物治療，身材矮小和下肢畸形可以通過肢體延長及肢體矯形手術進行改善，提高患兒生活質量。可以服用骨化三醇軟膠囊來改善骨的質量，但療效不確切。也可注射生長激素治療，對于軟骨發育不全患兒，療效也不是特別明顯。
手術治療：軟骨發育不全的患兒通常存在下肢畸形，需要通過手術的方式送生行矯正。對于身高明顯矮小，影響日常生活的患兒，需要通過肢體延長技術進行增高，以達到正常生活的目的。手術方式有肢體畸形矯正和肢體延長手術兩種。
第一、肢體畸形矯正：通常是下肢明顯的膝內翻患兒需要進行肢體矯工王手術，對于年齡較小出現膝關節畸形，可以通過半側骨骺阻滯的方法進行矯正，但由于軟骨發育不全生長能力很有限，通常需要較長時間或者矯正不理想。對于年齡稍大且生長潛力不足的患者，需要進行股骨及脛骨截骨的方式進行直接或者緩慢矯正，以獲得良好的下肢力線及正常的步態。
第二、肢體延長手術：由于軟骨發育不全患兒通常達不到正常身高水平，通常需要在兒童期進行一個長期的治療及生活計劃，包括未來的學習及就業計劃，要求家屬參與其中。由于身高相差超過30厘米，需要進行至少2~3次的股骨和脛骨延長，同時中間需要一次雙側肱骨延長，使得患者能夠進行正常的生活。
