1.致病原的區(qū)別，非淋一般是支原體、衣原體、生殖器皰疹、霉菌、滴蟲(chóng)感染。而前列腺炎的致病菌，除了有支原體、衣原體、霉菌、滴蟲(chóng)之外，還有細(xì)菌、鏈球菌等致病菌。
2.癥狀的不同，非淋菌性尿道炎表現(xiàn)為尿頻、尿急、尿道里癢，長(zhǎng)時(shí)間不排尿或者是晨起時(shí)，尿道外口有少量的異常的分泌物。而前列腺炎除了表現(xiàn)尿頻、尿急癥狀以外，可以有尿不盡，甚至出現(xiàn)尿?yàn)z留，會(huì)陰部、小腹部、肛門(mén)周?chē)霈F(xiàn)疼痛不適的感覺(jué)。
3.區(qū)別是治療，非淋菌型尿道炎通常根據(jù)化驗(yàn)的檢查結(jié)果，選擇敏感的抗生素靜脈或者是口服治療，而前列腺炎可以用抗生素的同時(shí)加用其他的藥物，如：α受體阻滯劑，5-α還原酶抑制劑以及抗炎的藥物，也可以進(jìn)行物理治療，有的患者可以采取手術(shù)的辦法。
4.預(yù)后，對(duì)于非淋性尿道炎預(yù)后良好，對(duì)于前列腺炎，由于病程纏綿、癥狀反復(fù)，絕大多數(shù)患者都是復(fù)發(fā)的。
