復方氟米松軟膏主要用于治療脂溢性皮炎、接觸性皮炎、異位性皮炎、局限性神經性皮炎、尋常型銀屑病、扁平苔癬，以及掌跖角化過度癥。用藥時需要注意的一些問題，第一點，本品是一種外用軟膏制劑，用藥前先洗凈雙手，然后將本品薄薄的涂在患處，并緩和的按摩一會兒。如果需要，患處可以遮蓋有孔的紗布。根據癥狀的輕重，每天1到2次。對于慢性皮膚病，不要突然停止治療，涂量需要逐步的減少，并以緩和劑代替，或改用輕效的藥物。第二點，兒童用藥連續使用不能超過兩周，兩歲以下的兒童使用不能超過7天，小兒用藥時需要注意其副作用。
第三點，氟米松軟膏不能用于皮膚的病毒感染，比如水痘、接種疫苗后引起的皮疹、單純皰疹、帶狀皰疹，也不用于細菌感染、真菌感染、牛痘、梅毒、皮膚結核、紅斑痤瘡，口周圍皮炎以及尋常痤瘡。第四點，當長期用藥，大面積用藥，封閉用藥或用于皮膚較薄的部位，比如面部、腋下，會導致毛細血管擴張、紫癜或類固醇痤瘡。所以大劑量用于大面積皮膚或封閉使用時，需要定期進行醫學監測，盡量避免長期用藥或用于面部。第五點，治療過程中，如果產生嚴重的刺激性或致敏性，應該停止用藥。本品不用于皮膚有滲出液的部位，也不用于黏膜部位。第六點，對于嚴重腎衰竭的病人，避免反復大面積用藥，運動員要慎用。
