治療原則是選用抗厭氧菌的藥物主要有甲硝唑，替硝唑和克林霉素。
第一次口服藥物，首選甲硝唑四百毫克每日兩次，口服共七日。替代方案就是甲硝唑兩克口服，每日一次，連服七日或者替硝唑口服每日一次，連服五日。還一種就是克林霉素三百毫克每日兩次連服七日。甲硝唑兩克頓服的治療效果差，不推薦使用。
第二點局部的藥物治療，含有甲呺唑的栓劑兩百毫克每日一次，共七日。或者是0.2%的克林霉素軟膏陰道涂抹每次五克，每晚一次連服七日。口服藥物與局部治療用藥療效相似，治愈率達到80%左右。
第三點是對于性伴侶的治療，雖然與多個性伴侶有關，但是對于性伴侶治療并未改善治療效果，即降低其復發，因此性伴侶不需要常規的治療。
第四妊娠期陰道病的治療，陰道病與不良的結局有關，比如絨毛膜羊膜炎，胎毛早破，早發宮縮，早產，產后子宮內膜炎等有關。妊娠合并心臟病的治療，是減少遇到感染的癥狀和體征，減少性陰道病有關感染的病證及其他感染，對于高危早產的孕婦，都無癥狀的性陰道病進行篩查及治療能否改善早產并發癥，尚無定論任何有正常的性陰道病孕婦，均需要進行篩查及治療，醫藥的方案為甲硝唑四百毫克口服，每日兩次連用七天或者是克林霉素三百毫克口服，一日兩次連用七天。
第五就去是隨仿治療后，無癥狀的不需要常規隨訪對妊娠合并，細菌性陰道病需要一定的隨訪治療效果。
