在臨床上低顱壓性頭痛，可以與以下疾病相混淆：
一是血管性的頭痛，血管性的頭痛大多是由于高血壓、低血壓、炎癥、冷熱刺激、疲勞、睡眠不足、過量飲酒等所引起，可以表現(xiàn)為全疼或者局部的持續(xù)性脹痛，甚至可能會出現(xiàn)低顱壓性頭痛相似的搏動痛，因為這種引起這種頭痛的原因，都是來自于血管，所以被統(tǒng)稱為血管性頭痛。
另外要與神經(jīng)性頭痛也是非常容易混淆，神經(jīng)性頭痛是原因不明或者神經(jīng)刺激所引起，大多數(shù)是部位不定的刺痛或者閃痛，另外還有一種肌緊張性的頭痛，大多是由于頸部肌肉的炎癥、缺血以及勞損所引起，有的會由于緊張疲乏，環(huán)境喧鬧，光線刺目等所誘發(fā)，大多會見于青壯年，女性較為多見，主要是以頸項為中心的枕部，肩臂、酸脹等疼痛。
?另外還有一些損傷性的頭痛，這種大多不難鑒別，都是由于顱腦外傷所引起，可以表現(xiàn)為劇烈的鈍痛、脹痛、跳痛，可以伴有意識性的改變。
還有一些是癲癇發(fā)作的前后，產(chǎn)生的頭痛這些也都不難鑒別，主要要根據(jù)病史以及臨床表現(xiàn)結(jié)合檢查來進(jìn)行鑒別。
