實驗室檢查白細胞計數和分類大多正常,如白細胞總數增多,中性粒細胞比例升高,c反應蛋白明顯高于正常,考慮合并細菌感染,取咽部泡液和糞便經組織培養和接種于鼠,可得致病病毒,同時可取的信息及恢復期血清進行特殊的中和抗體,補體結合和血凝抑制試驗以著確診。
在疾病流行期間根據典型癥狀和特征性咽峽部的損害,可以做出診斷,最好通過種損害畜分離到病毒,或者通過特征性的抗體滴液升高加以證實,但這些檢查并不推薦常規采用。
皰疹性口腔炎,其特點為任何季節均可發病,呈現更大持續更久的潰瘍,克薩奇a組實型病毒也會引起類似的病變,但口咽部損害突出,呈現白色到黃色的小結,治療需要對癥處理。