紅斑狼瘡是有遺傳傾向性及家族發病聚集性的,同卵孿生子共患系統性紅斑狼瘡的頻率要明顯高于雙卵孿生子,并且同卵孿生子一方患有紅斑狼瘡,另一方約有71%的會出現抗核抗體陽性,約有87%的出現高球蛋白血癥。
另外,紅斑狼瘡患者近親中本病的發生率要高于一般人群中紅斑狼瘡的發生率,說明遺傳因素對于紅斑狼瘡的發病有著重要的作用。
通常認為紅斑狼瘡是具有遺傳背景的個體在環境,性激素及感染等因素的共同作用與參與下引起的機體免疫功能異常,自身抗體產生,免疫復合物形成及其在各種組織的沉積,從而導致了紅斑狼瘡的發生和進展。