快速眼動(dòng)睡眠覺(jué)醒障礙的發(fā)病機(jī)制還不是很清楚，動(dòng)物的實(shí)驗(yàn)中損傷腦球張力遲緩或者是它的下行通路導(dǎo)致快速眼動(dòng)睡眠肌張力遲緩。人類大腦某些區(qū)域，比如邊緣系統(tǒng)可能會(huì)參與暴力夢(mèng)境和相關(guān)情境的情緒的產(chǎn)生。
有人研究發(fā)現(xiàn)，特發(fā)性的快速眼動(dòng)睡眠覺(jué)醒障礙患者的紋狀體多巴胺轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白減低，帕金森病患者紋狀體多巴胺受體嚴(yán)重減低，而相當(dāng)數(shù)量的帕金森病患者早期有快速眼動(dòng)睡眠覺(jué)醒障礙表現(xiàn)，因此就有假說(shuō)認(rèn)為就是紋狀體多巴胺系統(tǒng)功能障礙可能就是和快速眼動(dòng)睡眠覺(jué)醒障礙有關(guān)系。
但是快速眼動(dòng)像睡眠及張力遲緩的相關(guān)的一些精確的解剖變化和病理生點(diǎn)仍然存在一些爭(zhēng)議，快速眼動(dòng)睡眠覺(jué)醒障礙的易感因素包括像男性年齡在五十歲及以上有潛在的神經(jīng)系統(tǒng)疾病，或者是創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙等等。它的誘發(fā)因素包括服用藥物，尤其是抗抑郁藥文拉法辛、五羥色胺再攝取抑制劑、米氮平以及除安非他酮以外的其他的抗抑郁藥、β受體阻斷劑、膽堿酯酶抑制劑，司來(lái)吉蘭。此外吸煙、頭部外傷、暴露于殺蟲(chóng)劑等等，也是發(fā)生的環(huán)境危險(xiǎn)因素。
