對于橋本甲腺炎的實驗室檢查的項目,其中一個比較有特異性的抗體是抗甲狀腺過氧化酶抗體,大約90%的患者都有可能會出現;另外,20%到50%的患者會出現抗甲狀腺球蛋白的抗體,但是,甲狀腺球蛋白的抗體在確認橋本甲狀腺時,正確率比抗甲狀腺過氧化酶抗體更高。
萎縮性的甲狀腺炎患者大多是抗甲狀腺過氧化酶抗體呈陽性,處于亞臨床甲減時,tsh升高,而t3、t4正常;甲減時,提示t3、t4降低,而tsh明顯升高。甲狀腺核素掃描會顯示核素分布不均勻,但是缺乏特異性。
碘化物在甲狀腺性功能低下,以及萎縮性咽炎患者當中會降低,部分患者由于甲狀腺分泌有活性的碘化物,所以碘化物會升高,而且b超檢查也是有助于診斷。