?牙頜畸形的發生過程,可能由單一因素及單一機制起作用,也可能是多種因素,或多種機制共同作用的結果。從錯頜畸形形成的時間上來劃分,錯合畸形的病因,可分為先天性因素和后天性因素兩大類。但是針對個體錯頜畸形發生機制的角度來說,錯頜畸形的病因,可分為內在的遺傳因素和外界的環境因素。
錯頜畸形的遺傳因素,來源于種族演化和個體發育。種族演化主要是人類在數十萬年的進化過程中,隨著食物性質的改變,逐步導致人體咀嚼器官產生退化。在咀嚼系統的退化程度方面,咀嚼肌退化程度最大,頜骨次之,牙齒最小。
頜骨與牙齒退化程度不一致,導致牙量和骨量的不協調,牙齒產生擁擠,錯合畸形由此出現。個體發育與其它遺傳特征一樣,錯合畸形也可以由親代遺傳給子代。父母雙方牙合形態差異較大者,子代通常更容易患錯頜畸形。遺傳因素在錯頜畸形的病因中占比生較高。
環境因素包括疾病因素,口腔不良習慣,兒童替牙期常因局部障礙造成錯頜畸形。