一般引發牙周病的病因包括菌斑，菌斑是指粘附于牙齒表面的微生物群，不能用漱口水沖洗去除，現已公認菌斑是牙周病的始動因子，是引起牙周病的主要致病因素。
牙石是沉積在牙面上礦化的菌斑，根據其沉積部位和性質分為齦上牙石和齦下牙石兩種，齦上牙石是位于齦緣以上的牙面上，肉眼可直接看到，在牙頸部沉積較多，特別是在大涎腺導管開口相對處，如上頜磨牙的頰側和下頜前牙的舌側沉積更多。
齦下牙石位于齦緣以下，齦帶或者是牙周袋內的根面上，肉眼不能直視，必須用探針探查方能知其沉積部位和沉積量。齦下牙石在任何牙上均可形成，但以牙的鄰面和舌面較為多見，牙石對于牙周組織的危害主要是構成了菌斑附著和細菌滋生的良好環境，從而更加速了牙菌斑的形成，對牙齦組織形成了刺激。
創傷性咬合，咬合時若咬合力過大或方向異常，超越了牙周組織所能承受的合力，致使牙周組織發生損傷，稱為創傷性咬合。
創傷性咬合包括咬合時的早接觸，頜干擾，夜間磨牙等，其它包括食物嵌塞，不良修復體，口呼吸等因素，也會促使牙周組織的炎癥過程，其他全身因素在牙周病的發展中便屬于促進因子，全身因素可以降低或者改變牙周組織的對外來刺激的抵抗力，使之易于患病，并可促進齦炎和牙周炎的發展。
