呼吸系統疾病包括以下幾大類,主要是由細菌、病毒、真菌、結核菌、寄生蟲感染形成的肺部感染性疾病。
氣道阻塞性疾病常見有慢阻肺、支氣管哮喘、支氣管擴張、肺不張等。肺腫瘤主要有肺癌、肺轉移瘤、肺部的良性腫瘤等。肺循環疾病有肺栓塞、肺源性心臟病、肺動脈高壓。還有彌漫性的肺部疾病,主要是包括機化性肺炎、間質性肺病、肺血管炎、結節病等。
胸膜疾病是有胸腔積液和氣胸。胸腔積液中主要是指惡性胸腔積液、結核性胸腔積液、乳糜胸、肺炎旁胸腔積液等。
通氣調節功能障礙性疾病主要是指睡眠呼吸暫停綜合征。呼吸系統的危重癥,例如呼吸衰竭、急性呼吸窘迫綜合征、多臟器功能衰竭等。
其他肺部疾病,例如少見的疾病有肺隔離癥、塵肺、肺囊性纖維化等。