本病為自限性的疾病,如果沒有并發(fā)癥預后大多良好,病程在一到兩周左右,但也可以反復,少數的患兒恢復緩慢,如低熱,淋巴結腫大、乏力等可以達到數周甚至數月之久,在這個病以后偶爾可有一段時間的持續(xù)性的疲勞,但是沒有明確這與EB病毒引起的慢性疲勞綜合征有關。
本病的病死率是1%-2%,是因為并發(fā)中樞和神經麻痹引起的呼吸衰竭所致,其他少數病患死亡于病發(fā)脾破裂、腦膜炎、心肌炎、肝炎,但是本病與單核巨噬細胞系統(tǒng)的惡性病不同,不會轉化為淋巴瘤。
傳染性單核細胞增多癥如果發(fā)生在先天性免疫缺陷病的患兒可以迅速引起死亡。