卵巢囊腫應根據患者的年齡、生育要求、卵巢的大小綜合而定。如果卵巢囊腫為良性腫瘤,應根據患者年齡、生育要求及對側卵巢情況決定手術范圍。年輕單側良性腫瘤,應行患側卵巢腫瘤剝出或卵巢切除術,保留患側正常卵巢組織和對側正常卵巢。對于絕經后期婦女,應行子宮切除及雙側附件切除術,雙側良性腫瘤,應行腫瘤剝除術。
對于交界性腫瘤,主要是以手術治療為主。手術治療主要進行全面的手術分期和腫瘤細胞減滅術,年輕希望保留生育功能的一期患者,可保留正常的子宮和對側卵巢。對惡性腫瘤,治療原則上是以手術為主,輔以化療、放療等綜合治療。