鼻咽癌可能會并發很多不同的疾病。鼻咽癌侵犯了外展神經眼眶,會引起復視、眼球外凸;侵犯了三叉神經,可能會引起面部麻木感,可表現為痛覺和觸覺減退,也可以引起耳廓顳部,面頰部下唇的皮膚的麻木,感覺異常;另外還會導致耳鳴,聽力減退,耳內閉塞感,會發生卡他性中耳炎,單側耳鳴,聽力減退是早期鼻咽癌的癥狀之一;
另外還會出現頭痛,早期周圍間歇性頭痛,頭痛部位不固定,晚期則可能為持續性偏頭痛,主要是因為早期的神經血管反射引起,晚期的是由于腫瘤破壞顱底累及顱神經所致;還會有鼻塞,頸部淋巴結轉移,骨轉移,全身的惡病質等等。