陰道菌群非常復雜,除原蟲真菌外,還包括許多需氧菌及厭氧菌這些微生物,可以供其的生長在一個共同的陰道環境內,各微生物之間有拮抗作用,陰道內有乳酸桿菌保護,是健康陰道中的主要菌種。當來月經時這種平衡被破壞,相互制約作用消失,月經期內分泌激素發生改變,這些常住的菌群會變成致病菌,沖破陰道的屏障而引起感染。
同時因為使用的衛生巾也與女性外陰處直接接觸,衛生巾使用不當也會造成月經性陰道炎。月經性陰道炎一般就是因為女性月經期不注意個人衛生,和或經期性行為,或不經常更換衛生巾,或衛生巾本身不夠清潔,導致陰部污染進而出現炎癥。