慢性粒細胞白血病具體的發病原因并不是特別清楚。目前考慮慢性粒細胞白血病的發病有可能和電離輻射或者是接觸了一些化學毒物,比如說殺蟲劑、染發劑或者是苯及其衍生物,有些病毒感染也有可能和慢性粒細胞白血病的發生有關系,在這些因素的作用下,有可能會導致患者的染色體發生畸變。
發生慢性粒細胞白血病的時候,通常9號和22號染色體長臂平衡易位可以導致費城染色體的形成,所以發生慢性粒細胞白血病的時候,往往有可能會形成bcr-abl融合基因。出現這種融合基因,可以干擾細胞的正常生理功能,導致細胞過度增殖,細胞凋亡受到抑制,從而有可能會導致慢性粒細胞白血病的發生。