系統性紅斑狼瘡往往會出現多系統受累復雜的癥狀,所以在臨床上于其它疾病相鑒別的時候,主要是要根據患者一些臨床表現來加以鑒別,比如患者在病情活動期可能會有發熱的情況,所以要與一些感染性的疾病相鑒別,通常以完善抗體方面的檢測,也及一些病原菌的檢查。
另外,如果患者出現明顯貧血的癥狀,要與溶血性貧血相鑒別。此外,患者可能會以血小板減少疾病,要與原發性血小板減少性紫癜相鑒別。也有部分患者會以淋巴結增大起病,還會伴有發熱,要于能夠引起淋巴結增大的一些疾病,比如淋巴瘤、淋巴結核等相進行鑒別。此外,也有患者是以關節炎癥疾病,往往要與類風濕關節炎相鑒別,通常需要化驗一些相關的自身抗體,以及完善關節的超聲檢查等來進行鑒別。